首都儿科研究所内分泌科为国家儿科住院医师培训基地；世界糖尿病基金会-中国儿童糖尿病管理项目中心；中国儿童生长发育健康科普示范基地；儿童性早熟公益健康教育基地。中国普拉德·威利综合征（PWS）临床规范化诊疗协作联盟，全国罕见病儿科内分泌诊疗中心。国家级药物临床试验（GCP）基地。北京大学医学部儿科研究生培养基地。

1986年建立小儿内分泌专业门诊，2004年开设小儿内分泌专业病房，现有医生21人，内分泌专科护士12人。其中主任医师4名，副主任医师5名，主治医师10名，住院医师2名，其中博士后1名，博士5名，硕士11名。硕士研究生导师3名。小儿内分泌科由具有丰富临床经验的儿童内分泌专业医护人员组成，具有良好的专业梯队。主要诊治儿童糖尿病、矮小症、甲状腺疾病、肾上腺疾病、垂体疾病、代谢性骨病、性早熟、肥胖症、低血糖症等内分泌和遗传代谢性疾病。