1984年，流行病学研究室在著名儿科呼吸病专家张梓荆研究员倡议下成立，成为国内最早以群体医学视角研究儿童健康、发育和疾病规律的研究机构。作为儿科学、流行病学和卫生统计学博士和硕士研究生培养点，科室先后在历任主任林良明、米杰、陈芳芳的带领下，承担联合国儿童基金会、英国医学研究理事会基金、国家自然科学基金、973项目、“十一五”、“十二五”、“十三五”、“十四五”国家重点研发计划项目、科技部国家科技基础平台项目、北京市科技计划重大项目、北京市自然科学基金、首都医学发展基金等30余个项目/课题，并先后荣获“北京市职工创新工作室”、“科技北京”领军团队、“北京市儿童成人慢性病防治办公室”称号。