首都儿科研究所儿童营养研究中心于2021年7月1日正式成立。该中心由儿童营养临床指导与治疗、儿童营养研究与产品研发、儿童营养检测平台建设与服务及成果推广及互联网医疗服务的“研、医、检、推”四部分组成，将承担营养学、临床医学和预防医学的研究、指导和宣传的综合任务。它的成立在贯彻“健康中国”的战略要求、推进儿童保健中心的建设中具有里程碑式的意义。现设有保健营养、消化营养、慢性病营养、遗传基因、高危儿术后营养、风湿免疫营养6个专业门诊，以及饮食行为指导护理门诊。